雷吉洛克一出現就朝小智他們發動了攻擊，躲在後備箱的武藏和小次郎也被雷吉洛克嚇了一跳。
雷吉洛克頭上光點閃爍發射了破壞光線，路卡利歐的波導彈衝破之後打中了雷吉洛克，路卡利歐帶著幾人逃走了。
雷吉洛克鑽入地下追了過去，小智一行人往洞穴裏跑去。
路卡利歐道:“雷吉洛克攻擊我們是因為讓我們不要靠近可能是對入侵者的防衛。”
幾人穿過洞穴終於來到了世界之樹，這裏還保持著遠古時期的生態情況，各種化石神奇寶貝在這裏隨處可見。
琪朵道放出了調查模具和班克斯通話道:“這裏是創世之樹的正下方。”
幾架小型無人機在收集創世之樹的數據，如果這數據傳到外麵足以震撼整個世界。
雷吉斯奇魯踩爛了一個無人機
班克斯報告道:“這座岩石山是活著的，大自然所創造的礦物生命體吸收了光能活了幾萬年。”
小智一行人來到更上一層，小智喊道:“皮卡丘、阿勃梭魯在的話回答一聲！”
阿勃梭魯身上佩戴的超進化石閃爍光芒，皮卡丘也似乎聽到了聲音他們朝小智的位置跑去。
皮卡皮~
阿勃~
小智往上跑:“皮卡丘、阿勃梭魯！”
雷吉艾斯~
雷吉艾斯出現一道急凍光線打來，瑪夏多用影子球抵消了。
瑪夏多道:“我攔住它，你們走。”
小智道:“知道了，找到了皮卡丘他們就會來找你。”
瑪夏多笑著看小智他們離開轉頭對雷吉艾斯說道:“大冰塊，你的對手是我。”
雷吉艾斯再次發出急凍光線，瑪夏多身形一閃，輕鬆躲開。
瑪夏多快速移動，繞到雷吉艾斯身後，使出了暗影盜襲打中了。
雷吉艾斯先用鎖定，然後使用了暴風雪，中了鎖定的瑪夏多沒法躲這一擊正麵打中。
瑪夏多握緊拳頭說道:“可惡的大冰塊。”
小智一行人又回到創世之樹迎麵就看到掉下來的武藏和小次郎。
“就算是小鬼頭也無所謂了。”
“他們兩個追上來了。”
幾人抬頭一看是雷擊洛克和雷吉斯奇魯。
耿鬼、念力土偶主動從精靈球裏跑了出來。
雷吉斯奇魯的破壞光線打來，念力土偶用破壞光線、耿鬼用影子球勉強抵擋。
小智一行人拚命往前跑又來到外麵了在一條窄小的路上小心行走。
在幾人穿過之後路卡利歐用波導彈把這條路打斷了。
偵查的無人機悉數被水晶吸收，武藏、小次郎也被搖籃百合和多刺菊石獸樣子的能量體吸收了之前他們放出神奇寶貝讓他們逃離。
雷吉洛克和雷吉斯齊魯再次出現
“耿鬼和念力土偶被他們打倒了。”
琪朵道:“還不是說這些的時候快跑！”
班克斯道:“這是類似於白血球的物體是為了消滅體內的細菌。”
耿鬼和念力土偶躺在地上
耿鬼道:“可惡啊！擋得住第一波擋不住第二波，就這樣放他們兩個過去了。”
念力土偶用了睡覺在恢複體力。
夢幻、皮卡丘、阿勃梭魯、喵喵也來到了這裏。
喵喵:“好嚴重的傷啊。”
耿鬼道:“被雷吉洛克和雷吉斯奇魯打的， 我們是不要緊，小智他們可還在被追殺。”
夢幻用了神秘水滴幫耿鬼恢複體力。
小智和路卡利歐決定吸引雷吉洛克和雷吉斯奇魯的注意。
“出來吧蜥蜴王，黑魯加，形態進化，心靈升華，蜥蜴王、黑魯加超進化！”
路卡利歐在一旁大受震撼:“這個是什麽？他們的樣子改變了。”
“這個是超進化，訓練家和神奇寶貝心念相通然後有相應的超進化石，鑰石缺一不可，增強神奇寶貝力量的表現。”
“蜥蜴王對雷迪洛克用種子機關槍，黑魯加對雷迪斯奇魯使用噴射火焰。”
兩道攻擊打在他們身上雖然屬性占優，但是等級相差太多了見正麵打不過，小智和路卡利歐走另一條路離開了。
另一邊的小遙三人不樂觀全部被能量體吸收了神奇寶貝們從精靈球裏被放了出來。
小智用波導和超進化之間的感應找到了皮卡丘和阿勃梭魯。
耿鬼道:“小智！”
小智道:“耿鬼、念力土偶，你們沒事啊。”
瑪夏多身上有一些傷痕地從影子裏出來:“雖然有些曲折，但我還是跑來了。”
琪朵解釋大家全部被那些能量體吸進去了，幾人繼續往前跑結果路卡利歐被雷吉斯奇魯抓住了，小智和琪朵也被能量體困住。
小智把身上所有的神奇寶貝放了出來道:“對創世樹來說就是人類就是異類，可惡，這題無解該困還是要被困。”
琪朵也放出了他的兩隻瑪狃拉
所有的神奇寶貝流下了眼淚，喵喵在一旁看著，夢幻把小智的帽子給皮卡丘之後用他的力量把水晶變成綠色，幾人全都回來了。
神奇寶貝們都壓在小智身上
皮卡比~
耿鬼道:“你這家夥嚇死我了。”
瑪夏多擦幹眼淚道:“剛才我想和這棵樹拚命的心都有了。”
小智安撫道:“好了，好了，我知道了，你們先從我身上下來。”
夢幻:“經曆生死離別，你們的感情才能更加牢固啊，你們三個可以下去了。”
雷吉斯奇魯、雷吉洛克、雷吉艾斯見夢幻下令轉頭離開了。
喵喵道:“是夢幻剛才告訴創世樹你們不是細菌才把你們放出來的。”
琪朵道:“創世樹和夢幻有相互共存的關係。”
周圍的水晶變成紅色然後逐漸消散了，夢幻也變得非常虛弱
喵喵聽到小次郎的聲音朝著自己的夥伴們跑去。
係統:能量傳輸出了問題，激烈的活動讓創世樹產生了損壞，能量要是停止輸送的話，創世樹就會毀滅。
夢幻帶頭來到了創世樹心髒的位置，映入眼簾的是巨大的結晶。
路卡利歐發現了結晶旁有亞朗曾經戴過的手套結晶裏麵有亞朗的虛影。
小智用波導之力讓時間之花綻放一道白光閃過影像映入眼簾。
亞朗想通過夢幻的幫助解決戰爭於是就把波導之力全部傳給夢幻，自己也因為能量的消耗消散了。
小智道:“了解了把報道這裏傳給世界之樹，問題就解決了。”
路卡利歐重重點頭眼中閃爍著決然的光芒。
琪朵道:“可這樣你倆走上和亞朗一樣死亡的命運。”
小智\/路卡利歐道:“知道的。”
他倆深吸一口氣，開始調動體內的波導之力。
周圍的空氣開始劇烈震蕩，一道道藍色的光芒從他們體內湧出，匯聚在他們的雙手之間。光芒越來越耀眼，形成了一個的藍色能量球。
“波導之力存於我心！”小智和路卡利歐同時大喊。
他們雙手向前一推，那蘊含著波導之力的能量球緩緩朝著夢幻飛去，一股強大的力量開始蔓延開來。
“不能放棄！”小智咬緊牙關，加大了對波導之力的輸出。路卡利歐也全力以赴，它的身體微微顫抖，但眼神卻無比堅定。
係統:唉，本來用我不就行了快點花費20萬積分問題就解決了。
“你不早說。”
“你這不也沒問。”
小智支付了20萬積分讓創世樹恢複，水晶散發出柔和而溫暖的光芒，仿佛在向小智和路卡利歐表達著感激之情。
小智和路卡利歐疲憊地癱坐在地上，但臉上卻洋溢著勝利的喜悅。
時間之花另一個影像傳來亞朗癱坐在結晶前:“對不起，路卡利歐，如果告訴你真相，你也會一起跟過來吧，把你封印起來是逼不得已的，用生命換戰爭的終止，我一個人就夠了，我沒有遺憾，再見了，路卡利歐。”
路卡利歐跪在結晶麵前痛哭流涕
瑪夏多道:“你這麽哭他知道了該多傷心啊，打起精神來你要替他好好活著。”
路卡利歐站起了身擦幹眼淚道:“我知道了。”
小智和琪朵找到了小瑤，小剛，小勝之後告別了夢幻回到了歐魯德朗城堡
艾琳女王熱情地歡迎他們回來並問路卡利歐之後的打算。
路卡利歐思索片刻後回答道:“我決定跟著小智大人跟他到外麵旅行。”
瑪夏多伸出手說道:“歡迎你的加入。”
小智用精靈球把路卡利歐收服了，係統獎勵2000積分、路卡利歐超進化石。
艾琳女王把勇者之杖給了小智:“這個東西在你那裏更合適。”
小智高高興興地接過，這個東西讓路卡利歐拿著也挺合適
路卡利歐接過之後緊緊握住
小勝道:“可以在上麵別個帶子背在背後不然一直手拿著很麻煩吧。”
小智牽起小遙的手說道:“答應過你的，要補一支舞。”
音樂響起，小智和小遙步入大廳中央。他們的眼神交匯，周圍的人們紛紛圍攏過來，微笑著注視著這一對佳人。
隨著音樂的節奏，他們翩翩起舞，舞步輕盈而協調，小遙的裙擺在旋轉間飛揚，宛如盛開的花朵。
艾琳女王身邊的老傭說道:“在解決危機之後勇者和愛人跳起舞蹈這次的事件又將成為一個新的傳說。”
小智一行人離開了歐魯德朗城堡繼續前往對戰巨蛋。
雷吉洛克頭上光點閃爍發射了破壞光線，路卡利歐的波導彈衝破之後打中了雷吉洛克，路卡利歐帶著幾人逃走了。
雷吉洛克鑽入地下追了過去，小智一行人往洞穴裏跑去。
路卡利歐道:“雷吉洛克攻擊我們是因為讓我們不要靠近可能是對入侵者的防衛。”
幾人穿過洞穴終於來到了世界之樹，這裏還保持著遠古時期的生態情況，各種化石神奇寶貝在這裏隨處可見。
琪朵道放出了調查模具和班克斯通話道:“這裏是創世之樹的正下方。”
幾架小型無人機在收集創世之樹的數據，如果這數據傳到外麵足以震撼整個世界。
雷吉斯奇魯踩爛了一個無人機
班克斯報告道:“這座岩石山是活著的，大自然所創造的礦物生命體吸收了光能活了幾萬年。”
小智一行人來到更上一層，小智喊道:“皮卡丘、阿勃梭魯在的話回答一聲！”
阿勃梭魯身上佩戴的超進化石閃爍光芒，皮卡丘也似乎聽到了聲音他們朝小智的位置跑去。
皮卡皮~
阿勃~
小智往上跑:“皮卡丘、阿勃梭魯！”
雷吉艾斯~
雷吉艾斯出現一道急凍光線打來，瑪夏多用影子球抵消了。
瑪夏多道:“我攔住它，你們走。”
小智道:“知道了，找到了皮卡丘他們就會來找你。”
瑪夏多笑著看小智他們離開轉頭對雷吉艾斯說道:“大冰塊，你的對手是我。”
雷吉艾斯再次發出急凍光線，瑪夏多身形一閃，輕鬆躲開。
瑪夏多快速移動，繞到雷吉艾斯身後，使出了暗影盜襲打中了。
雷吉艾斯先用鎖定，然後使用了暴風雪，中了鎖定的瑪夏多沒法躲這一擊正麵打中。
瑪夏多握緊拳頭說道:“可惡的大冰塊。”
小智一行人又回到創世之樹迎麵就看到掉下來的武藏和小次郎。
“就算是小鬼頭也無所謂了。”
“他們兩個追上來了。”
幾人抬頭一看是雷擊洛克和雷吉斯奇魯。
耿鬼、念力土偶主動從精靈球裏跑了出來。
雷吉斯奇魯的破壞光線打來，念力土偶用破壞光線、耿鬼用影子球勉強抵擋。
小智一行人拚命往前跑又來到外麵了在一條窄小的路上小心行走。
在幾人穿過之後路卡利歐用波導彈把這條路打斷了。
偵查的無人機悉數被水晶吸收，武藏、小次郎也被搖籃百合和多刺菊石獸樣子的能量體吸收了之前他們放出神奇寶貝讓他們逃離。
雷吉洛克和雷吉斯齊魯再次出現
“耿鬼和念力土偶被他們打倒了。”
琪朵道:“還不是說這些的時候快跑！”
班克斯道:“這是類似於白血球的物體是為了消滅體內的細菌。”
耿鬼和念力土偶躺在地上
耿鬼道:“可惡啊！擋得住第一波擋不住第二波，就這樣放他們兩個過去了。”
念力土偶用了睡覺在恢複體力。
夢幻、皮卡丘、阿勃梭魯、喵喵也來到了這裏。
喵喵:“好嚴重的傷啊。”
耿鬼道:“被雷吉洛克和雷吉斯奇魯打的， 我們是不要緊，小智他們可還在被追殺。”
夢幻用了神秘水滴幫耿鬼恢複體力。
小智和路卡利歐決定吸引雷吉洛克和雷吉斯奇魯的注意。
“出來吧蜥蜴王，黑魯加，形態進化，心靈升華，蜥蜴王、黑魯加超進化！”
路卡利歐在一旁大受震撼:“這個是什麽？他們的樣子改變了。”
“這個是超進化，訓練家和神奇寶貝心念相通然後有相應的超進化石，鑰石缺一不可，增強神奇寶貝力量的表現。”
“蜥蜴王對雷迪洛克用種子機關槍，黑魯加對雷迪斯奇魯使用噴射火焰。”
兩道攻擊打在他們身上雖然屬性占優，但是等級相差太多了見正麵打不過，小智和路卡利歐走另一條路離開了。
另一邊的小遙三人不樂觀全部被能量體吸收了神奇寶貝們從精靈球裏被放了出來。
小智用波導和超進化之間的感應找到了皮卡丘和阿勃梭魯。
耿鬼道:“小智！”
小智道:“耿鬼、念力土偶，你們沒事啊。”
瑪夏多身上有一些傷痕地從影子裏出來:“雖然有些曲折，但我還是跑來了。”
琪朵解釋大家全部被那些能量體吸進去了，幾人繼續往前跑結果路卡利歐被雷吉斯奇魯抓住了，小智和琪朵也被能量體困住。
小智把身上所有的神奇寶貝放了出來道:“對創世樹來說就是人類就是異類，可惡，這題無解該困還是要被困。”
琪朵也放出了他的兩隻瑪狃拉
所有的神奇寶貝流下了眼淚，喵喵在一旁看著，夢幻把小智的帽子給皮卡丘之後用他的力量把水晶變成綠色，幾人全都回來了。
神奇寶貝們都壓在小智身上
皮卡比~
耿鬼道:“你這家夥嚇死我了。”
瑪夏多擦幹眼淚道:“剛才我想和這棵樹拚命的心都有了。”
小智安撫道:“好了，好了，我知道了，你們先從我身上下來。”
夢幻:“經曆生死離別，你們的感情才能更加牢固啊，你們三個可以下去了。”
雷吉斯奇魯、雷吉洛克、雷吉艾斯見夢幻下令轉頭離開了。
喵喵道:“是夢幻剛才告訴創世樹你們不是細菌才把你們放出來的。”
琪朵道:“創世樹和夢幻有相互共存的關係。”
周圍的水晶變成紅色然後逐漸消散了，夢幻也變得非常虛弱
喵喵聽到小次郎的聲音朝著自己的夥伴們跑去。
係統:能量傳輸出了問題，激烈的活動讓創世樹產生了損壞，能量要是停止輸送的話，創世樹就會毀滅。
夢幻帶頭來到了創世樹心髒的位置，映入眼簾的是巨大的結晶。
路卡利歐發現了結晶旁有亞朗曾經戴過的手套結晶裏麵有亞朗的虛影。
小智用波導之力讓時間之花綻放一道白光閃過影像映入眼簾。
亞朗想通過夢幻的幫助解決戰爭於是就把波導之力全部傳給夢幻，自己也因為能量的消耗消散了。
小智道:“了解了把報道這裏傳給世界之樹，問題就解決了。”
路卡利歐重重點頭眼中閃爍著決然的光芒。
琪朵道:“可這樣你倆走上和亞朗一樣死亡的命運。”
小智\/路卡利歐道:“知道的。”
他倆深吸一口氣，開始調動體內的波導之力。
周圍的空氣開始劇烈震蕩，一道道藍色的光芒從他們體內湧出，匯聚在他們的雙手之間。光芒越來越耀眼，形成了一個的藍色能量球。
“波導之力存於我心！”小智和路卡利歐同時大喊。
他們雙手向前一推，那蘊含著波導之力的能量球緩緩朝著夢幻飛去，一股強大的力量開始蔓延開來。
“不能放棄！”小智咬緊牙關，加大了對波導之力的輸出。路卡利歐也全力以赴，它的身體微微顫抖，但眼神卻無比堅定。
係統:唉，本來用我不就行了快點花費20萬積分問題就解決了。
“你不早說。”
“你這不也沒問。”
小智支付了20萬積分讓創世樹恢複，水晶散發出柔和而溫暖的光芒，仿佛在向小智和路卡利歐表達著感激之情。
小智和路卡利歐疲憊地癱坐在地上，但臉上卻洋溢著勝利的喜悅。
時間之花另一個影像傳來亞朗癱坐在結晶前:“對不起，路卡利歐，如果告訴你真相，你也會一起跟過來吧，把你封印起來是逼不得已的，用生命換戰爭的終止，我一個人就夠了，我沒有遺憾，再見了，路卡利歐。”
路卡利歐跪在結晶麵前痛哭流涕
瑪夏多道:“你這麽哭他知道了該多傷心啊，打起精神來你要替他好好活著。”
路卡利歐站起了身擦幹眼淚道:“我知道了。”
小智和琪朵找到了小瑤，小剛，小勝之後告別了夢幻回到了歐魯德朗城堡
艾琳女王熱情地歡迎他們回來並問路卡利歐之後的打算。
路卡利歐思索片刻後回答道:“我決定跟著小智大人跟他到外麵旅行。”
瑪夏多伸出手說道:“歡迎你的加入。”
小智用精靈球把路卡利歐收服了，係統獎勵2000積分、路卡利歐超進化石。
艾琳女王把勇者之杖給了小智:“這個東西在你那裏更合適。”
小智高高興興地接過，這個東西讓路卡利歐拿著也挺合適
路卡利歐接過之後緊緊握住
小勝道:“可以在上麵別個帶子背在背後不然一直手拿著很麻煩吧。”
小智牽起小遙的手說道:“答應過你的，要補一支舞。”
音樂響起，小智和小遙步入大廳中央。他們的眼神交匯，周圍的人們紛紛圍攏過來，微笑著注視著這一對佳人。
隨著音樂的節奏，他們翩翩起舞，舞步輕盈而協調，小遙的裙擺在旋轉間飛揚，宛如盛開的花朵。
艾琳女王身邊的老傭說道:“在解決危機之後勇者和愛人跳起舞蹈這次的事件又將成為一個新的傳說。”
小智一行人離開了歐魯德朗城堡繼續前往對戰巨蛋。