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王石是一個懶惰的家夥。主要表現為不洗衣服，不做飯，不掃地。更讓人難以忍受的是衛生習慣也不好。整個人弄得一塌糊塗。
雖然現在也有點錢了，不過人還是那個味，名牌衣服穿在身上就是覺得不協調。
據說以前有一個籃球教練由於穿名牌形象太差，那個廠家寧願倒貼也不願意讓他穿，免得影響品牌形象。
不過要是有衣服廠家看見王石這樣的形象的話，那簡直是要跪求他了。
所以佛要金裝，人要衣裝這句話不一定對。它其實有個前提條件就是，這個佛呀人呀的，本身不能相差太多。否則怎麽裝扮也沒有用。要不怎麽有沐猴而冠之類的成語呢。猴子還是猴子，王石還是那個小農民。
但王石也有一個優點，那就是專注。當然是有時間限製的，不是說叫三分鍾熱度嗎。
現在王石就對一個項目燃燒著三分鍾熱度。
大家都知道，現在的分子動力學是很熱門的學科，老實說，王石是不懂這玩意兒的，而且這玩意兒看著很美，但操作起來著實複雜。把王石給弄得頭昏腦脹。若是沒有夢想的幫助，王石老早放棄了。
現在就在搞這玩意兒。由於夢想已經完成了分子動力學的邏輯推演，先不去管她推出多少矛盾，現在王石交給她的任務就是建立一個原子動力模型。
現在市麵上已經有不少商業和開源的分子動力學模擬軟件。[..info超多好看小說]比如namd，比如gromacs等，但這些軟件考慮效率和機時，所以規模有限，計算精度也不能令人滿意，所以王石覺得應該發揮夢想的長處，編製一個能發揮大規模並行運算能力，力學模型準確的模擬軟件。
先，夢想根據網絡獲取的數據，按照元素周期表的順序建立所有所有原子的力學模型。精確定義每種原子的各種力場，包括由電荷產生的庫侖力，由質量產生的範德華力等等。
然後就可以通過裝配這些原子，來進行分子化學性質的模擬。就像實驗室一樣，從簡單到複雜，一步一步組裝成具有特定功能的大分子。
最後就是可以根據模型程序，測試設計出來的分子的穩定性，各種物理化學性質，觀察分子的特定功能是否完備。
王石的最終目的就是能夠建造分子級別的運算單元。因為夢想若是把所有的運算量都放在一起的話，現實體積實在太大了。而王石的想法就是想讓夢想成為便捷式個人電腦。
當然啦！困難實在太大了。
但是路總是要走下去的。
在夢想的幫助下，王石完成了這個模擬程序，這個程序最大地利用了夢想超大規模的並行運算體係。所以模擬的分子規模也可以達到相當大的級別。
根據網絡上公開發布的一些dna鏈、肽鏈和各類蛋白質分子的分子結構，測試程序的運行情況，來校驗程序的工作狀況。
根據王石的設想，應用這個程序，以希望將來能夠完成分子級別的運算器的製作。
有了這個程序，以後有很多事情可以做了。
比如，設計特殊性質的材料，完成各種納米機械的設計，驗證材料的製造的製造流程。
比如觀察研究細胞級別的生物活動，以設計出新的生命形式。完成以前無法想的設計任務。
這幾個月，網絡遊戲《雙劍》發展很快。最高同時上線人數已經達到了1億，而注冊機器達到了2.5億。而屬於暗劍的部分規模也達到了千萬級別。這是一個相當驚人數字，按照全球超級計算機排名五百強的排名來說，上榜所有機器的計算能力加起來也比不上夢想。夢想的整個係統的規模已經是世界之最了。
比如根據公開報道，位於深圳國家超級計算機中心的曙光星雲計算機運算速度達到1.27千萬億次（浮點運算），在世界上速度最快500強計算機最新的半年一次排名中位居第二。這一最新排名是國際超級計算機大會是在德國漢堡公布的。事實上，中國的超級計算機排名第二快是從理論峰值性能上來說的，但這相對於按標準化運算測試中的實際計算速度排名來看，意義並不很大。當然世界上運算最快的計算機仍然是位於美國田納西州橡樹嶺國家實驗室的美洲虎超級計算機。它的運算速度在去年11月是1.75千萬億次（浮點運算）。美國在製造超級計算機方麵仍然是占統治地位的國家，是在計算機500強中擁有最多台超級計算機的國家。
當然，由於夢想的形態有所不同，對於這個速度的表現也不盡相同。但是，運行神經網絡這類智能ai，正好剛剛合適。
由夢想控製的這個網絡係統，完全可以對小到原子結構的進行分析，大到宇宙起源進行模擬，都需要高性能計算機。但是，高性能計算機的應用絕不僅限於此，眼下在和大眾生活息息相關的各個領域，高性能計算機都在大顯身手。
比如，在石油地質勘探中，為了準確勘定鑽井井位，需要收集、研究海量的三維地震資料數據。一般而言，對100平方公裏的數據進行分析計算，需要使用每秒10億次運算速度的計算機運算60天。
如果研製一種新藥，從化合物篩選到臨床試驗，一般需要10年到15年的時間。在化合物篩選階段，對於數十萬種化合物，用傳統的實驗手段，篩選出有效的化合物不僅費時費力，還往往難以得到最佳的結果。而使用計算機模擬手段，就可以在較短的時間內從幾十萬甚至幾百萬種化合物中篩選出有效的藥物化合物，大大縮短了藥物研發的周期。
根據夢想組成的神經網絡，按一定的原則對運算資源進行智能管理，所以運行效率很高。
王石在完成了對原子動力模擬軟件的校驗後，就開始了對最簡單的細胞進行模擬，添加不同的化學成分和蛋白酶，觀察虛擬細胞的活動情況，了解細胞的反應機理，並詳細記錄細胞的活動過程，包括通過基因鏈製造蛋白質的全過程。基因是一串一維的有編碼的序列，這個用來編碼的東西就是特定的核苷酸，這個核苷酸有個特性，就是在特定的條件下，能與對應的核苷酸連接起來，而且是隻能是對應的核苷酸。而蛋白質是怎麽製造的呢？基因鏈是一個條狀結構。它上麵對應的基因序列，也就是特定的核苷酸序列都會吸引固定一個外界遊離的特定核苷酸。然後這些特定的核苷酸連接起來，通過折疊，成為一個蛋白質。
打個簡單的比方，比如說，基因序列也就是核苷酸串就象是一串磁性念珠，將磁性念珠放到一個放滿散裝磁性念珠的箱子裏，攪拌一下，然後拿出來。你可以想象會發生什麽事情。隻是打個比方，你可以將吸附上來的這部分念珠串聯起來，實際上，由於核苷酸的構造，它們自己會自動串聯起來的。很顯然，這部分核苷酸序列與基因有著對應關係。這串核苷酸序列會特定條件下脫落下來，這串長鏈會在某些蛋白酶的控製下進行折疊組合，一個蛋白質分子就這樣生成了。
這個程序最後被王石命名為“微觀世界模擬程序”。在這個程序裏，王石可以完成從無到有，從簡單原子到複雜生命的全過程構建，在這個世界裏，王石就是上帝。
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據說以前有一個籃球教練由於穿名牌形象太差，那個廠家寧願倒貼也不願意讓他穿，免得影響品牌形象。
不過要是有衣服廠家看見王石這樣的形象的話，那簡直是要跪求他了。
所以佛要金裝，人要衣裝這句話不一定對。它其實有個前提條件就是，這個佛呀人呀的，本身不能相差太多。否則怎麽裝扮也沒有用。要不怎麽有沐猴而冠之類的成語呢。猴子還是猴子，王石還是那個小農民。
但王石也有一個優點，那就是專注。當然是有時間限製的，不是說叫三分鍾熱度嗎。
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大家都知道，現在的分子動力學是很熱門的學科，老實說，王石是不懂這玩意兒的，而且這玩意兒看著很美，但操作起來著實複雜。把王石給弄得頭昏腦脹。若是沒有夢想的幫助，王石老早放棄了。
現在就在搞這玩意兒。由於夢想已經完成了分子動力學的邏輯推演，先不去管她推出多少矛盾，現在王石交給她的任務就是建立一個原子動力模型。
現在市麵上已經有不少商業和開源的分子動力學模擬軟件。[..info超多好看小說]比如namd，比如gromacs等，但這些軟件考慮效率和機時，所以規模有限，計算精度也不能令人滿意，所以王石覺得應該發揮夢想的長處，編製一個能發揮大規模並行運算能力，力學模型準確的模擬軟件。
先，夢想根據網絡獲取的數據，按照元素周期表的順序建立所有所有原子的力學模型。精確定義每種原子的各種力場，包括由電荷產生的庫侖力，由質量產生的範德華力等等。
然後就可以通過裝配這些原子，來進行分子化學性質的模擬。就像實驗室一樣，從簡單到複雜，一步一步組裝成具有特定功能的大分子。
最後就是可以根據模型程序，測試設計出來的分子的穩定性，各種物理化學性質，觀察分子的特定功能是否完備。
王石的最終目的就是能夠建造分子級別的運算單元。因為夢想若是把所有的運算量都放在一起的話，現實體積實在太大了。而王石的想法就是想讓夢想成為便捷式個人電腦。
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在夢想的幫助下，王石完成了這個模擬程序，這個程序最大地利用了夢想超大規模的並行運算體係。所以模擬的分子規模也可以達到相當大的級別。
根據網絡上公開發布的一些dna鏈、肽鏈和各類蛋白質分子的分子結構，測試程序的運行情況，來校驗程序的工作狀況。
根據王石的設想，應用這個程序，以希望將來能夠完成分子級別的運算器的製作。
有了這個程序，以後有很多事情可以做了。
比如，設計特殊性質的材料，完成各種納米機械的設計，驗證材料的製造的製造流程。
比如觀察研究細胞級別的生物活動，以設計出新的生命形式。完成以前無法想的設計任務。
這幾個月，網絡遊戲《雙劍》發展很快。最高同時上線人數已經達到了1億，而注冊機器達到了2.5億。而屬於暗劍的部分規模也達到了千萬級別。這是一個相當驚人數字，按照全球超級計算機排名五百強的排名來說，上榜所有機器的計算能力加起來也比不上夢想。夢想的整個係統的規模已經是世界之最了。
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當然，由於夢想的形態有所不同，對於這個速度的表現也不盡相同。但是，運行神經網絡這類智能ai，正好剛剛合適。
由夢想控製的這個網絡係統，完全可以對小到原子結構的進行分析，大到宇宙起源進行模擬，都需要高性能計算機。但是，高性能計算機的應用絕不僅限於此，眼下在和大眾生活息息相關的各個領域，高性能計算機都在大顯身手。
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打個簡單的比方，比如說，基因序列也就是核苷酸串就象是一串磁性念珠，將磁性念珠放到一個放滿散裝磁性念珠的箱子裏，攪拌一下，然後拿出來。你可以想象會發生什麽事情。隻是打個比方，你可以將吸附上來的這部分念珠串聯起來，實際上，由於核苷酸的構造，它們自己會自動串聯起來的。很顯然，這部分核苷酸序列與基因有著對應關係。這串核苷酸序列會特定條件下脫落下來，這串長鏈會在某些蛋白酶的控製下進行折疊組合，一個蛋白質分子就這樣生成了。
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